KAJIAN IN SILICO AGONIS PPAR GAMMA-RECEPTOR PROTEIN (5Y2O) SEBAGAI ANTIHIPERGLIKEMIA MENGGUNAKAN DOCK6

Abstract

Diabetes mellitus (DM) tipe 2 merupakan penyakit gangguan metabolisme heterogen yang ditandai dengan hiperglikemia serta adanya resistensi terhadap sekresi insulin. Aktivasi PPARγ meningkatkan penyerapan glukosa dan pemanfaatannya di organ perifer, merangsang penyimpanan asam lemak dalam adiposit, meningkatkan pensinyalan insulin, dan mengurangi glukoneogenesis di hati, sehingga meningkatkan sensitivitas insulin. Aktivitas antihiperglikemia untuk menguji senyawa dapat dilakukan salah satunya dengan molecular docking. Protein target yang digunakan memiliki kode PDB 5Y2O. Preparasi protein dimulai dengan menggunakan UCSF Chimera. Proses docking dilakukan menggunakan software DOCK6 dengan metode fleksibel dan rigid. Interaksi ligan dengan protein target divisualisasikan secara 3D dengan PyMol dan visualisasi interaksi ligan dengan protein target menggunakan PLIP. Hasil grid score ligan natif (8N6) yang diperoleh untuk metode fleksibel  adalah -42,37kkal/mol dan untuk metode fleksibel adalah -42,03 kkal.mol. Didapat dua ligan uji terbaik untuk masing-masing metode. Ligan uji terbaik dengan metode fleksibel adalah 4147757 dan 2523552, keduanya memiliki grid score berturut-turut -47,64 dan -47,44 kkal/mol. Ligan uji terbaik dengan metode rigid adalah 71751677 dan 71751678, keduanya memiliki grid score -46,85kkal/mol.  Ligan uji dikatakan memiliki aktivitas yang lebih baik dari ligan natif bila nilai grid score ligan uji semakin negative daripaa nilai grid score ligan natif, semakin negatif nilai dari grid score maka semakin sedikit energi yang dibutuhkan ligan untuk berikatan dengan protein target, sehingga ligan akan mudah berikatan dengan protein target.  Dua ligan uji terbaik dari masing-masing metode memiliki grid score lebih negatif daripada ligan natif pada masing-masing metode. Hasil visualisasi interaksi ligan didapatkan adanya interaksi antara ligan dan protein target. Interaksi yang ada didalamnya adalah interaksi hidrofobik dan ikatan hidrogen, adapun untuk ligan dengan metode fleksibel terdapat interaksi Phi-Cation.

Kata Kunci : antidiabetes, 5Y2O, docking molekular, PPAR gamma.